Ландшафт транскриптома, различающегося по полу, и его последующий отбор у взрослых людей

2017г 6500 женских генов отличается от мужских и работают иначе из них 1145 не связаны с молочными железами или половыми органами

Ориг.: The landscape of sex-differential transcriptome and its consequent selection in human adults
Авторы: Gershoni, M., Pietrokovski, S
Дата: 7.02.2017г
Журнал: BMC Biology 15, Article number: 7 (2017)
DOI: 10.1186/s12915-017-0352-z
Ссылки: bmcbiol.biomedcentral.com; PDF: bmcbiol.biomedcentral.com

6500 женских генов отличается от мужских и работают иначе из них 1145 не связаны с молочными железами или половыми органами

6500 генов имеют разную экспрессию и ведут себя иначе у женщины и мужчины

Количество генов также различается, у женщин 2 X-хромосомы а у мужчины X и Y хромосомы, но может вы незнаете что вторая X хромосома у женщины неактивна

Мужчины и женщины имеют почти идентичные геномы, но отчетливо диморфны, с разной восприимчивостью к болезням.

Исследование всесторонне картировало генетическую архитектуру, зависящую от пола, в 53 тканях человека. Анализ имеющихся данных РНК-секвенирования 544 взрослых выявил тысячи генов, дифференциально экспрессируемых в репродуктивных путях и тканях, общих для обоих полов.

Гены, зависящие от пола, связаны с различными биологическими системами и предлагают новые идеи патофизиологии различных заболеваний человека.

Мы также выявили значительную связь между транскрипцией генов, зависящих от пола, и снижением эффективности отбора и накоплением вредных мутаций, которые могут влиять на распространенность различных признаков и заболеваний. Интересно, что многие из генов, зависящих от пола, которые также подвергаются снижению эффективности отбора, необходимы для успешного воспроизводства у мужчин или женщин. Этот кажущийся парадокс может частично объяснить высокую частоту случаев бесплодия у людей.

На фоне схожей экспрессии в большинстве тканей большинства генов существует более 6500 генов, кодирующих белок, со значительным различием по полу выражением (далее SDF) по крайней мере в одной ткани.

Наиболее дифференцированной по полу тканью с 6123 генами, кодирующими белок SDE, являются молочные железы, как отмечалось ранее. Это предполагает существенные различия в физиологии и генетической архитектуре пола этой ткани. Мы обнаружили, что 1145 генов являются SDE в тканях, не относящихся к молочным железам. Наиболее дифференцированными из этих тканей с более чем 100 генами SDE являются скелетные мышцы, две кожные ткани, подкожная жировая клетчатка, передняя поясная извилина и левый желудочек сердца.

Большинство тканей GTEx имеют более семидесяти образцов. Эта вариация размера выборки может влиять на количество идентифицированных генов SDE на ткань. Коэффициент корреляции Пирсона между размером выборки и числом идентифицированных генов SDE составляет 0,10 для 45 проанализированных тканей, общих для мужчин и женщин, и 0,57, если исключить ткань молочных желез.

Это говорит о том, что размер выборки вносит вклад в различия в числе идентифицированных генов SDE на ткань, хотя несколько тканей заметно отклоняются от этой тенденции (например, ткани молочной железы и цельной крови). Помимо числа генов SDE, ткани также можно сгруппировать по паттернам оценок генов SDE. Этот анализ показал, что две ткани кожи, жировая подкожная и желудочная, больше всего отклоняются от всех других тканей, и что семь из тринадцати тканей мозга сгруппированы вместе